Το πρωτάθλημα της Ε.Π.Σ. Πειραιώς περιόδου 1960-61 διοργανώθηκε σε τέσσερις κατηγορίες, την πρώτη (με συμμετοχή οκτώ συλλόγων), τη δεύτερη (σε 2 ομίλους των έξι), την τρίτη και την τέταρτη επίσης με δυο φάσεις και με οκτώ και έξι συλλόγους στα "τελικά" τους αντίστοιχα. Τον τίτλο της Α΄ κατηγορίας κατέκτησε ο Πανελευσινιακός, που μαζί με τον δεύτερο στην τελική κατάταξη Βύζαντα Μεγάρων και την τρίτη Α.Ε. Χαλκηδόνα Νήαρ Ηστ προκρίθηκαν για το ειδικό πρωτάθλημα τύπου Β΄Εθνικής του 1961.
Το πρωτάθλημα έληξε την πρωτοχρονιά του 1961 με τρεις αγώνες[1] χωρίς βαθμολογικό ενδιαφέρον καθώς οι τρεις πρώτες θέσεις είχαν ήδη κριθεί και είχαν σχηματιστεί και οι όμιλοι της Β΄ Εθνικής.
Στην τελική φάση συμμετείχαν οι 2 πρώτοι κάθε ομίλου:Πειραϊκός , Πανασπροπυργιακός από τον Α και Νεάπολις, ΑΕ Ποντίων από τον Β. Πρωταθλήτρια ανακηρύχθηκε η Νεάπολις κερδίζοντας στον τελευταίο αγώνα την ΑΕ Ποντίων[2]
Στην τελική φάση συμμετείχαν 6 ομάδες. Οι αγώνες ολοκληρώθηκαν στις 7 Μαΐου και πρωταθλήτρια της Δ΄ ήταν η ομάδα των Άσπρων Χωμάτων.[3] Μάλιστα επιβλήθηκε και στους αγώνες διαβάθμισης επί του ουραγού της Γ΄ Αχιλλέα με 1-0 και 8-0. Την επόμενη περίοδο στη Γ΄ Κατηγορία αγωνίστηκαν και η 2η Κύπρος και 3η ΑΕ Περάματος.